Ниже приведены настройки IRC с комментариями, последняя вкладка также видна на скриншоте:

General: на этой вкладке можно сменить сервер, назначить автоматический коннект на сервер после запуска Trillian. Также можно перейти к окну IRC Server Manager описанному здесь.
Connection:
- Reconnect on disconnect: автоматический реконнект при разрыве соединения с сервером.
- Try Next: пробовать следующий сервер .
- Stay in group when cycling servers: пробовать только сервера в группе (насколько я понимаю).
- Wait period between attempts: период ожидания между попытками.
- Number of attempts: число попыток.
Остальное не знаю, кроме Your IP adress: ваш IP адрес на данный момент.
DCC: настройки DCC. Насколько мне известно, DCC, это прямое соединение между хостами минуя сервера. Дает возможность организовать чат и передавать файлы. Могу ошибаться.
Friend/Enemy/Flood Lists: одни догадки. Возможно ники занесенные в Friend list получают защиту от встроенной в Trillian флуд-защиты (flood protection. О ней ниже). Тогда непонятно зачем нужен Enemy list. Как узнаю, сообщу.
- Ignor list: оправлять врагов в игнор. Можно указать тип игнора - не показывать всё, сообщения, нотисы, приглашения и пр.
Miscellaneous: прочее
- Options:
   - Rejoin on kick: если вас выкинут с канала (kick), Trillian автоматически вернет вас обратно.
   - CTCP cloaking: пока не знаю.
   - Show PING/PONG messages: сообщает, когда сервер вас пингует.
   - Show op/voice status on nick: подставляет к нику символ-статус. Для операторов, это @. Для voice (имеющие голос при включенной на канале опции +m (moderated), это +. Не имеет смысла для Trillian, так как он разделяет их на группы. Можно не включать.
   - Open empty consol on start: открыть консоль (служебное окно) при подключении.
   - Enable hostmask checking w/notify: точно пока не знаю.
   - Default ban type: банить (блокировать вход на канал) юзера по определенной маске. По умолчанию: *!hostmask (любой ник с определенного хоста).
   - Command charaster: символ, определяющий ваше сообщение как команду. Прямой слэш по умолчанию.
- Default messages: сообщения по умолчанию.
   - Default kick messages: если вы применяете команду /kick <nick> в канал выдается сообщение содержащее комментарий. Комментарий можно добавить непосредственно в команду: /kick <nick> <comment>.
   - Signoff message: выдается при выходе с сервера. Например: *** Signoff: zwitter (Quit from Abakan IRC: меня больше нет с вами!). Аналогично команде /quit <message> (дисконектит от сервера с выдачей в канал указанного сообщения).
- Flood Protection: заигнорить юзера за n сообщений выданных в канал/приват в n секунд. Заигнорить на n секунд. Рекомендую установить указанные на скриншоте значения. При них Trillian фактически не игнорит. Даст вам возможность увидеть, к примеру, выданный в канал безвредный стих в десяток строк. При этом, действительно вредительский флуд как правило пресекается сервисами канала или его операторами. Ниже указан список ников, защищенных от flood-protection, по умолчанию в нем два основных сервиса: NickServ (сервис ников) и ChanServ (сервис каналов).